Таблица 1. Характеристика на 20 щама Y. enterocolitica 4/О:3
Щам
|
Фаготип
|
Произход
|
Източник
|
Страна
|
Пулсотип
|
IP4214
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Гърция
|
4А
|
IP4302
|
VIII
|
човек
|
неидентиф
|
Германия
|
4А
|
IP6041
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
4А
|
IP7011
|
VIII
|
човек
|
кръв
|
Франция
|
4А
|
IP7596
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
4А
|
IP8492
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Испания
|
4А
|
IP8896
|
VIII
|
човек
|
неидентиф
|
Италия
|
4А
|
IP8944
|
VIII
|
човек
|
кръв
|
Гърция
|
4А
|
IP22435
|
IXa
|
човек
|
неидентиф
|
Франция
|
4А
|
IP23111
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
4А
|
IP6908
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Испания
|
4B
|
IP864
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Белгия
|
4C
|
IP22785
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Италия
|
4D
|
IP4424
|
VIII
|
свиня
|
тонзила
|
Белгия
|
4E
|
IP7841
|
IXa
|
човек
|
фецес
|
Африка
|
4F
|
IP10393
|
VIII
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
4G
|
IP4244
|
IXb
|
човек
|
фецес
|
Канада
|
4H
|
IP4439
|
VIII
|
свиня
|
тонзила
|
Холандия
|
4I
|
IP22701
|
XI
|
човек
|
неидентиф
|
Чили
|
4J
|
IP22276
|
IXb
|
човек
|
фецес
|
Австралия
|
4K
|
|
Фигура 2
NotI рестрикционни профили на 20 щама Y. enterocolitica 2/О:9 след ГЕПП (номерата на щамовете съответстват на тези от Таблица 1); А-L – пулсотипове на съответните щамове; 200-50 – размер на ДНК фрагментите (кб)
|
Не се наблюдава корелация между пулсотипа от една страна и географският произход и фаготипа от друга, на щамовете от серотип О:5. Анализът на фигура 3 показва, че профилите получени след ГЕПП са силно хетерогенни при пулсотиповете на щамове от биотип 1А, докато пулсотиповете на щамове от биотип 3 са значително по-хомогенни. Ето защо може да се приеме, че пулсотипа е свързан с биотипа на щамовете. Щамовете Y. enterocolitica 1А са непатогенни и са изолирани от околната среда, докато тези от биотип 3 са патогенни. Профилите на щамове от 3/О:5 са хомогенни и достатъчно специфични за да ги диференцират от щамовете на 4/О:3 и 2/О:9.
Таблица 2. Характеристика на 20 щама Y. enterocolitica 2/О:9
Щам
|
Произход
|
Източник
|
Страна
|
Пулсотип
|
|
IP 19917
|
храна
|
свинско месо
|
Аржентина
|
2А
|
|
IP 22370
|
храна
|
шунка
|
Аржентина
|
2А
|
|
IP 22373
|
храна
|
свинско месо
|
Аржентина
|
2А
|
|
IP 22374
|
храна
|
колбас
|
Аржентина
|
2А
|
|
IP 22352
|
храна
|
месо
|
Аржентина
|
2А
|
|
IP 383
|
човек
|
фецес
|
Белгия
|
2В
|
|
IP 19262
|
човек
|
фецес
|
Турция
|
2С
|
|
IP 21251
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
2D
|
|
IP 21349
|
човек
|
неидентифициран
|
Франция
|
2D
|
|
IP 22349
|
храна
|
свинско месо
|
Аржентина
|
2E
|
|
IP 21404
|
храна
|
яйца
|
Аржентина
|
2F
|
|
IP 20188
|
човек
|
неидентифициран
|
Холандия
|
2G
|
|
IP 23073
|
човек
|
кръвен кoагулум
|
Франция
|
2G
|
|
IP 21194
|
човек
|
кръв
|
Швейцария
|
2H
|
|
IP 20754
|
човек
|
фецес
|
Швейцария
|
2I
|
|
IP 20851
|
човек
|
фецес
|
Испания
|
2J
|
|
IP 23128
|
говедо
|
фецес
|
Франция
|
2K
|
|
IP 21447
|
свиня
|
фецес
|
Англия
|
2K
|
|
IP 23038
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
2K
|
|
IP 23039
|
човек
|
кръв
|
Франция
|
2L
|
|
|
Фигура 3
NotI рестрикционни профили на 20 щама Y. enterocolitica серотип О:5 след ГЕПП (номерата на щамовете съответстват на тези от Таблица 3); А-R – пулсотипове на съответните щамове; 200-50 – размер на ДНК фрагментите (кб)
|
Резултатите показват, че при Y. enterocolitica О:5, пулсотипа отразява повече биотипа, отколкото серотипа. Това се потвърждава и с йерсинии от биосеротип 3/О:3 (Табл. 4). Щамовете IP23438 и IP23446 (от кучета в Испания), показват един и същ пулсотип, който е различен от пулсотипа на щам IP22227, изолиран в Австралия. Въпреки че трите 3/О:3 щама имат специфични и ненаблюдавани досега пулсотипове, техните профили като цяло са по-сходни на 3/О:5, отколкото на щамовете 4/О:3 (Фиг. 4).
1.2. Анализ на пулсотипа на двойки щамове, изолирани от един и същи пациент или близки роднини
С цел определянето на епидемиологичната стойност на ГЕПП при взривове от Y. enterocolitica са сравнени пулсотиповете на двойки щамове изолирани от един и същи пациент, но в различни периоди от време или от друг пациент от други места. Рестрикционните профили на щамовете във всяка двойка, получени с ензима NotI, са идентични (Фиг. 5, линии 1-4), което показва, че пулсотипът на Y. enterocolitica е стабилен in vivo.
|
Фигура 4
Сравняване на NotI рестрикционните профили на 3 щама Y. enterocolitica 3/О:3 с пулсотипа на 1 щам 4/О:3 и 3/О:5 след ГЕПП; размерът на ДНК фрагментите е от 50 до 200 кб; линии: 1 - IP864 (4/О:3), 2 – IP22227 (3/О:3), 3 – IP23438 (3/О:3), 4 – IP23446 (3/О:3), 5 – IP885 (3/О:5)
| Таблица 3. Характеристика на 20 щама Y. enterocolitica О:5
Щам
|
Био
тип
|
Фаго
тип
|
Произход
|
Източник
|
Страна
|
Пулсо
тип
|
IP21398
|
1А
|
Xo
|
коза
|
неидентиф
|
Аржентина
|
1АА
|
IP22345
|
1А
|
Xo
|
храна
|
бройлер
|
Аржентина
|
1АА
|
IP22376
|
1А
|
Xz
|
говедо
|
тонзила
|
Аржентина
|
1АА
|
IP21160
|
1А
|
Xz
|
ок. среда
|
неидентиф
|
Гърция
|
1АB
|
IP20952
|
1А
|
Xz
|
човек
|
фецес
|
Швейцария
|
1АC
|
IP22661
|
1А
|
Xo
|
свиня
|
цекум
|
Аржентина
|
1АD
|
IP21385
|
1А
|
Xz
|
храна
|
риба
|
Франция
|
1АE
|
IP20721
|
1А
|
Xz
|
храна
|
мляко
|
Франция
|
1АF
|
IP23040
|
1А
|
Xz
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
1АG
|
IP20351
|
1А
|
Xz
|
човек
|
фецес
|
Франция
|
1АH
|
IP21370
|
1А
|
Xz
|
храна
|
бройлер
|
Франция
|
1АI
|
IP22783
|
1А
|
Xz
|
човек
|
апендикс
|
Италия
|
1АJ
|
IP22260
|
1А
|
Xz
|
храна
|
яйца
|
Франция
|
1АK
|
IP21110
|
1А
|
Xo
|
храна
|
сирене
|
Испания
|
1АL
|
IP21131
|
1А
|
Xo
|
храна
|
сметана
|
Испания
|
1АM
|
IP21363
|
1А
|
Xz
|
храна
|
морков
|
Франция
|
1АN
|
IP22464
|
3
|
Xz
|
човек
|
неидентиф
|
Австралия
|
3O
|
IP22981
|
3
|
Xz
|
човек
|
кръв
|
Франция
|
3P
|
IP21100
|
3
|
Xz
|
човек
|
кръв
|
Франция
|
3Q
|
IP885
|
3
|
Xz
|
куче
|
фецес
|
Англия
|
3R
|
Таблица 4. Характеристика на 3 щама Y. enterocolitica 3/O:3
Щам
|
Произход
|
Страна
|
Пулсотип
|
IP22227
|
овца
|
Австралия
|
3А
|
IP23438
|
куче
|
Испания
|
3B
|
IP23446
|
куче
|
Испания
|
3B
|
|
Фигура 5.
NotI рестрикционни профили на двойки щамове Y.enterocolitica, изолирани от един и същи пациент или близки роднини; 100 до 150 кб - размер на ДНК фрагментите; Щамовете (линии 1 до 10) съответстват на тези от Табл. 5. (←) различен фрагмент в щамовете, изолирани от две сестри
|
Сравняването на профилите на тези щамове дава възможност първата двойка да се определи като пулсотип 4А, а втората като пулсотип 2К. За да се докаже, че различните гостоприемници не оказват селективен натиск, който би могъл да промени геномните профили на бактериите, бяха изследвани 3 двойки щамове изолирани от близки роднини, с подобни клинични симптоми в къс период от време (Табл. 5). Двата щама, изолирани от съпрузи, показват един и същи профил и са от пулсотип 4А (Фиг. 5, линии 5-6). Двата щама, изолирани от баща и дъщеря са с еднакъв профил и се отнасят към пулсотип 2К (линии 7-8), което би могло да означава, че генома на Y. enterocolitica е стабилен, след преминаване през различни гостоприемници. Третата двойка щамове бе изолирана от две сестри, боледували по едно и също време с подобни клинични признаци (Табл. 5). Въпреки че рестрикционните профили на тези щамове са почти идентични, единият от тях има един допълнителен фрагмент (Фиг. 5), което се доказва и с използването на рестрикционния ензим XbaI.
Каталог: IMB%20web%20page -> pzrasrbpzrasrb -> Статии, публикувани в международни списания: Ivanov I., Georgiev V., Georgiev M., Ilieva M., Pavlov A. (2011)pzrasrb -> Биосинтез на галантамин от растителни in vitro системи на Leucojumpzrasrb -> Конкурс за доцент по профeсионално направление Биологически науки, специалност 01. 06. 12. Микробиология, обявен от Института по микробиология при бан в дв, бр. 21 от 01. 03. 2013 гpzrasrb -> Лекция на shoot тип линии Leucojum aestivumpzrasrb -> Асистент Иван Георгиев Иванов, докторант в Института по микробиология „Стефан Ангелов”pzrasrb -> Председателя на Научното жури определено със заповедpzrasrb -> На статиите на д-р Милка Милчева Милева, представени при кандидатстване за хабилитация I. Публикации, свързани с дисертационнатаpzrasrb -> Чл кор проф д-р Мила Власковска, дф., дмн., Университетската
Сподели с приятели: |