Семинар по Патогенни микроорганизми и инфекциозна имунология към Института по микробиология "Стефан Ангелов", бан на 13. 06. 2011 и насочен за защита на същото заседание

Фигура 2 NotI рестрикционни профили на 20 щама Y. enterocolitica 2/О:9 след ГЕПП (номерата на щамовете съответстват на тези от Таблица 1); А-L – пулсотипове на съответните щамове; 200-50 – размер на ДНК фрагментите (кб)

Щам	Произход	Източник		Страна	Пулсотип
IP 19917	храна	свинско месо		Аржентина	2А
IP 22370	храна	шунка		Аржентина	2А
IP 22373	храна	свинско месо		Аржентина	2А
IP 22374	храна	колбас		Аржентина	2А
IP 22352	храна	месо		Аржентина	2А
IP 383	човек	фецес		Белгия	2В
IP 19262	човек	фецес		Турция	2С
IP 21251	човек	фецес		Франция	2D
IP 21349	човек	неидентифициран		Франция	2D
IP 22349	храна	свинско месо		Аржентина	2E
IP 21404	храна	яйца		Аржентина	2F
IP 20188	човек	неидентифициран		Холандия	2G
IP 23073	човек	кръвен кoагулум		Франция	2G
IP 21194	човек	кръв		Швейцария	2H
IP 20754	човек	фецес		Швейцария	2I
IP 20851	човек	фецес		Испания	2J
IP 23128	говедо	фецес		Франция	2K
IP 21447	свиня	фецес		Англия	2K
IP 23038	човек	фецес		Франция	2K
IP 23039	човек	кръв		Франция	2L
			Фигура 3 NotI рестрикционни профили на 20 щама Y. enterocolitica серотип О:5 след ГЕПП (номерата на щамовете съответстват на тези от Таблица 3); А-R – пулсотипове на съответните щамове; 200-50 – размер на ДНК фрагментите (кб)

Резултатите показват, че при Y. enterocolitica О:5, пулсотипа отразява повече биотипа, отколкото серотипа. Това се потвърждава и с йерсинии от биосеротип 3/О:3 (Табл. 4). Щамовете IP23438 и IP23446 (от кучета в Испания), показват един и същ пулсотип, който е различен от пулсотипа на щам IP22227, изолиран в Австралия. Въпреки че трите 3/О:3 щама имат специфични и ненаблюдавани досега пулсотипове, техните профили като цяло са по-сходни на 3/О:5, отколкото на щамовете 4/О:3 (Фиг. 4).

С цел определянето на епидемиологичната стойност на ГЕПП при взривове от Y. enterocolitica са сравнени пулсотиповете на двойки щамове изолирани от един и същи пациент, но в различни периоди от време или от друг пациент от други места. Рестрикционните профили на щамовете във всяка двойка, получени с ензима NotI, са идентични (Фиг. 5, линии 1-4), което показва, че пулсотипът на Y. enterocolitica е стабилен in vivo.

Фигура 4 Сравняване на NotI рестрикционните профили на 3 щама Y. enterocolitica 3/О:3 с пулсотипа на 1 щам 4/О:3 и 3/О:5 след ГЕПП; размерът на ДНК фрагментите е от 50 до 200 кб; линии: 1 - IP864 (4/О:3), 2 – IP22227 (3/О:3), 3 – IP23438 (3/О:3), 4 – IP23446 (3/О:3), 5 – IP885 (3/О:5)

Фигура 5. NotI рестрикционни профили на двойки щамове Y.enterocolitica, изолирани от един и същи пациент или близки роднини; 100 до 150 кб - размер на ДНК фрагментите; Щамовете (линии 1 до 10) съответстват на тези от Табл. 5. (←) различен фрагмент в щамовете, изолирани от две сестри

Сравняването на профилите на тези щамове дава възможност първата двойка да се определи като пулсотип 4^А, а втората като пулсотип 2^К. За да се докаже, че различните гостоприемници не оказват селективен натиск, който би могъл да промени геномните профили на бактериите, бяха изследвани 3 двойки щамове изолирани от близки роднини, с подобни клинични симптоми в къс период от време (Табл. 5). Двата щама, изолирани от съпрузи, показват един и същи профил и са от пулсотип 4^А (Фиг. 5, линии 5-6). Двата щама, изолирани от баща и дъщеря са с еднакъв профил и се отнасят към пулсотип 2^К (линии 7-8), което би могло да означава, че генома на Y. enterocolitica е стабилен, след преминаване през различни гостоприемници. Третата двойка щамове бе изолирана от две сестри, боледували по едно и също време с подобни клинични признаци (Табл. 5). Въпреки че рестрикционните профили на тези щамове са почти идентични, единият от тях има един допълнителен фрагмент (Фиг. 5), което се доказва и с използването на рестрикционния ензим XbaI.