Характеризира с тежко септично състояние – температура, втрисане, обилно изпотяване, силна отпадналост, главоболие, безсъние, често бълнуване, безапетитие и др. Езикът е сух. По кожата се явяват петехиални обриви. Черният дроб и слезката са увеличени. От страна на сърцето поради улцеро-некротичните процеси на клапите настъпват разкъсвания и пробиви по тях, в резултат на което се появяват сърдечни шумове. Те имат груб характер, често с музикален (мяукащ тембър). Характерно е, че те са бързо променливи – намаляват или се усилват от ден на ден поради бързите морфологични промени на клапите. Характерен признак са емболиите. Те са септични и пренасят инфекцията, поради което на мястото, където са попаднали се развиват гнойни процеси. Това може да стане в различните вътрешни органи (бъбреци, черен дроб, слезка, мозък, бели дробове и др.). В тези органи се развиват т.нар. висцерални инфаркти. Засягат се още крайниците, ставите. В кръвта се установява неутрофилна левкоцитоза, ускоряване на утаяването на еритроцитите, понякога тромбоцитопения и др. Хемокултурата доказва често, но не винаги причинителя.
Клиничното заболяване може да започне неусетно и неотчетливо. Поради това, че причинителите на този вид ендокардит обичат да се поселват върху предварително увредени сърдечни клапи, болните започват да се уморяват лесно, като умората се засилва от ден на ден. Вечер температурата се покачва над 37 °C, достига до 37,5 – 38 °C, обикновено без тръпки. Понякога болните се изпотяват със спадането на температурата. Често се оплакват от главоболие, безапетитие и др. С времето болестта напредва и в клиничната картина се оформят три синдрома: инфекциозен, периферносъдов и сърдечен.
Инфекциозен синдром
Инфекциозният синдром най-често се изявява с температура, която рядко може да добие септичен характер, тръпки и по-рядко втрисане, обилно изпотяване, бледо до бледожълтеникаво лице. В напреднал стадий лицето добива цвят на мляко с кафе. Лигавиците са също бледи, анемични. Слезката е увеличена. Черният дроб също се увеличава. В редица случаи се наблюдават барабанни пръсти.