Когато кислорода се подава във високи концентрации и продължително време то може да бъде токсичен за организма. Усложненията застрашават живота на болния и могат да предизвикават трайна инвалидизация. Отнася се най-вече за новородените, недоносените деца. Най-чести и сложни са:
Ретролентална фиброплазия – разрастване на влакнестата съединителна тъкан поради незрялост на ретината. Това състояние завършва с ослепяване. За да се избегне, върху очите се слага марля с физологичен разтвор или с унгвент и се покриват с марли
Изсушване (изгаряне на лигавица) на носа, устата. За да се избегне е необходиумо кислородът да бъде овлажнен, да се следи количеството и концентрацията на подавания кислород, стойностите на прациалното налягане на кислорода в артериалната кръв и стриктно да се спазват назначенията на лекаря за продълбителността на кислородотерапията.