Територията на кариера Кунино попада в периферните части на Защитена зона BG0000332 “Карлуковски карст“ по Директива Дир.79/409/EE за опазване на птиците. Тя е от тип J Защитена зона по Директива за птиците, която се съдържа в защитена зона по Директива за местообитанията. Общата площ на ЗЗ BG0000332 “Карлуковски карст“ е 142 086.90 дка. По класове земно покритие площта на ЗЗ се разпределя в следните групи:
