направени в хода на следствието, и наличието на вещите и предметите, които той използвал за шпионската си дейност, предрешават до голяма степен хода на съдебния процес, проведен в края на 1968 г. Самият Сарафов добре разбирал тежестта на своето престъпление. Пред съда той прави изказване, че му е ясно какво е вършил и че ще получи заслуженото.
На 9 декември 1968 г. съдът чете присъдата - смърт чрез разстрел на основание член 104 от НК. Съден е и по член 250, ал. 2 от НК за извършени валутни нарушения. Конфискувано му е цялото недвижимо имущество и леката кола “Пежо”. Присъдата е изпълнена на 12 март 1969 г.