редица трудности свързани с въвеждането на системите за управление. На първо място се нареждат високите разходи за внедряванев т.ч. за разработване и сертификация. Следвани от затруднения в хода на самия процес по внедряване -сложност на изискванията на стандарта; дълго време за внедряване; голям обем документооборот. Често трудностите се дължат и на организациятана процеса вътре във фирмата -липса на ангажираност от страна нависшето ръководство и служителите; неадекватна организационна структура и култура; липса на квалифицирани служители; нежелание за иновации и технологични промени и липса на инвестиции в научно-изследователска и развойна дейност.